Первое упоминание о чудесах, происходивших там, где сегодня раскинулась Троице-Сергиева Лавра, дошло до нас со времен основания монастыря. Ещё до того, как святой Сергий Радонежский пришел на холм Маковец, место это было хорошо известно окрестным жителям.
Как Сергий был предназначен к служению Святой Троице, так и выбранное им место будто бы самим Господом было уготовано для устроения его обители. Радонежские «лесные люди» - бортники и охотники - ещё задолго до преподобного приметили холм в десяти верстах от Хотькова. Те из них, кому случалось заночевать в лесу, будто бы наблюдали яркий свет, струящийся над землей, некоторые видели даже языки пламени, а иные явственно ощущали разлившееся в воздухе благоухание. И Сергий, умевший распознать Божий промысел, встретился с этим местом, исполненный благоговения и доверия.



Множество чудес свершилось здесь в первые годы существования обители. Прежде окрестности Маковца были лишены питьевой воды, ибо речка Консера (ныне - Кончура) мелка и мутна, вода её не очень пригодна для питья. И вот как-то раз Сергий, взяв с собой одного инока, пошел с ним в лесной овраг под монастырем. Там нашли они немного дождевой воды. Преподобный преклонил над лужицей колена и помолился. И едва произнес молитву, как тотчас из-под земли пробился обильный источник холодной ключевой воды, и потекла она ручьем по долине. Вода эта оказалась целебной.
Сергию Радонежскому людская молва приписывает открытие и другого животворного источника - водопада «Гремячий ключ», расположенного около деревни Ляпино. Легенда гласит, что в этом месте останавливался помолиться преподобный на пути из Лавры в Киржач. «Гремячий» является уникальным природным памятником, представляя собой несколько сильных источников, бьющих из расщелины в середине крутого известнякового склона.


Не иссякали чудеса и по смерти Сергия. В Едигеево нашествие 1408 года, когда татаро-монголы уже подошли к Москве, оставленный Сергием после себя игуменом преподобный Никон Радонежский призывал на помощь своего учителя, прося защитить дом Пресвятой Троицы. Однажды, задремав после молитвы, он увидел святителей Московских Петра и Алексия, а с ними и Сергия, который сказал ему, Никону: «Господу угодно, чтобы иноплеменники коснулись этого места. Но ты, чадо, не скорби и не смущайся: обитель не запустеет, а процветет ещё более». И предсказание святого исполнилось: монастырь был сожжён, но иноки, предупрежденные своим заступником, успели уйти в безопасное место.
Разорение монастыря тогда даже сослужило ему добрую службу. Братия быстро отстроила обитель заново, начала заменять деревянные строения каменными. А в канун сентябрьского Сергиева дня 1608 года, когда под стены лаврские явились поляки, священноинок Пимен вечером горячо молился пред иконой Богоматери и вдруг увидел из своей кельи необыкновенно яркий свет. Решив, что неприятель поджег монастырь, Пимен выбежал из кельи и узрел ярко сиявший огненный столп, поднимавшийся над главой Троицкой церкви. Потом огненный столп начал мало-помалу опускаться, обратился в светлое облачко и свился сквозь окно в храм.
А вот в 1812 году, когда Наполеон рвался к Москве и его отряды рыскали по всем окрестностям, ни один француз почему-то так и не наткнулся на богатую обитель. Считается, что и это - Сергиево заступничество.



Уже упоминавшийся нами Симон Азарьин рассказал о ещё одном чуде: «Храм Святой Троицы, где покоятся мощи преподобного Сергия, не так сильно охлаждается в зимнее время от мороза, как прочие каменные церкви, но как бы содержит в себе легкую прохладу, и люди в нём не страдают от мороза. Кроме того, внутри алтаря Святыня, которой приносится Небесному Царю Непорочная Жертва, не замерзает даже в лютые морозы, но невидимой силой Божией согревается, как от солнечного тепла, и руки служащих, по их словам, не зябнут».

Самый знаменитый целебный источник Троице-Сергиевой Лавры обретён был в 1644 году во время ремонта паперти Успенского собора. От его воды получил исцеление слепой монах Пафнутий, а некий служка монастыря, усомнившийся в животворности воды, пал замертво. Последующие чудеса утвердили народ в вере в чудодейственность источника, и к нему потянулись страждущие со всех концов России. Часовня над источником, сооруженная в конце XVII века и по форме подобная миниатюрному четырехъярусному храму, увенчана куполом и крестом. Как и другие монастырские постройки того времени, она богато украшена резьбой и покрыта многоцветной росписью. Стенная роспись и иконы относятся к XIX веку.